危房改造是政府行为，属于政府的阶段性工作，一般情况下政府会设立临时性的组织机构（政府危房改造工作领导小组或办公室）来组织实施，这类机构设在住建委（城镇）或新农村建设办公室（农村）。 居委申请程序是：农村申请危房改造需要这些程序：符合农村危房改造条件的家庭，户主可向村民委员会提出书面申请，由村民委员会对初定危房改造对象予以公示后，再填写申请表，并签订建新拆旧协议，一同上报乡（镇）政府。乡（镇）政府对上报材料进行审查，对申请人的住房和家庭经济情况等进行核实。乡（镇）政府调查后，符合条件的，报县危房改造领导小组审批；不符合条件的，将材料退回。然后再由县政府对乡（镇）上报的申请材料实地复核，若符合补助条件，将予以批准，并核定资助方式及标准。最后，县政府根据省、市下达的年度农村危房改造任务和资金，结合实际组织实施。竣工后的危房改造项目，由县住房和城乡规划建设管理局会同相关部门对翻建新建、修缮加固住房进行全面检查验收。城镇则须通过居民委和街道办事处逐级申报申批。
危房改造按照街道申请、区住建局实地查看、市房屋安全专家鉴定、市棚户区改造指挥部统一拆迁安置的程序进行。只有经过市里专家组鉴定为危房的，才能进行改造拆迁，拆迁补偿安置办法采用棚户区改造拆迁补偿安置办法，没有区别。近期西安区有三个地块的棚户区改造实行协议拆迁的方式，既先签补偿安置协议，但不搬迁，待回迁选楼前三个月再腾空房屋，经验收后方可选楼，市政府给三个月的过度费。在拆迁区域内，经市里专家组鉴定为危房的，原则上必须搬迁，市政府承担过渡期的过渡费，危房的其它补偿安置办法同棚户区改造拆迁补偿安置办法一致。
农村学校危房由学校向当地教育局危房管理部门管理，发现危房：首先是电话向上级管理部门通报该学校有危房并作危房登记，然后是书面呈上危房情况，内容包括危房危险程度，危房建造年限，以及危房多方面面高清照片，上级主管部门根据资料落实危房及采取措施，最后申请危房学校根据本校实际妥善安排防危措施，并申请改造危房资金的费用通过分项列举出清单由主管部门审批解决。其中危房改建资金最好把每一环境需要的费用估算清楚含有相关施工图纸等。
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